本所於民國四十一年七月一日與臺灣臺北監獄分立後，全銜為臺灣臺北地方法院看守所，民國六十九年七月一日，審檢分隸，改稱為臺灣臺北看守所。民國一百年一月一日因應行政院組織改造，再更名為法務部矯正署臺北看守所並附設法務部矯正署臺北監獄臺北分監。

本所原設於臺北市愛國東路一號，該處本為臺北市郊區，後因社會繁榮人口增長，逐漸發展成市區中心，已不適宜作為刑事被告羈押之處所，復以房舍為日據時期所遺留，建築年久，陳舊簡陋，設施亦不符現代刑事政策之要求，乃有遷建計劃。民國五十九年層奉核定，將愛國東路原址有償撥用予郵政及中華電信機構使用，幾經周折，始購妥現址土地─新北市土城區立德路二號。建築工程由榮民工程處承包，六十一年六月五日動土，同年九月四日正式開工，至六十四年五月底，主要舍房次第完成，同年七月二十日遷入啟用。部份後續及附屬工程，如作業工場、材料倉庫、員工宿舍、停車場等，亦於六十八年底全部竣工。

自九十九年六月十九日起不再附設女所，女性收容人改由「臺灣臺北女子看守所」收容，亦於一百年元月一日因組改更名為「法務部矯正署臺北女子看守所」。